Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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UBE2E3Q969T4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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