Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COPS9Q8WXC6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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