Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GIPC3Q8TF64 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms