Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSRQ86X29 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms