Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETMD1Q6P1Q0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms