Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms