Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms