Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF4Q15306 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms