Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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