Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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