Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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