Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNEQ04844 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms