Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms