Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDR2Q01850 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms