Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UFM1P61960 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms