Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC01547P58512 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms