Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GBX2P52951 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GBX2P52951 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GBX2P52951 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GBX2P52951 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GBX2P52951 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX2P52951 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX2P52951 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms