Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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