Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms