Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP2P42575 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms