Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CBP42338 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms