Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL1P40616 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL1P40616 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms