Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGCXP38435 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms