Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPB2P35606 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPB2P35606 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPB2P35606 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPB2P35606 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPB2P35606 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPB2P35606 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms