Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGS2P35354 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGS2P35354 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms