Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms