Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PLNP26678 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms