Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A1P22736 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms