Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTLA4P16410 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTLA4P16410 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTLA4P16410 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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