Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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