Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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