Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP9BO43861 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms