Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNMO15061 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNMO15061 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNMO15061 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNMO15061 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms