Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM3A6NNA2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms