Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM35Q9UPQ4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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