Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
L1RE1Q9UN81 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms