Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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