Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA9Q9BWV2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms