Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms