Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHCHD6Q9BRQ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHCHD6Q9BRQ6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms