Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM7Q9BQ49 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms