Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms