Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYT9Q86SS6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYT9Q86SS6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms