Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms