Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms