Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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