Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA3Q16281 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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