Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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