Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMB3Q13751 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms