Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms